Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clint1Q99KN9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clint1Q99KN9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms