Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps4Q99KG7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps4Q99KG7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms