Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp11Q99K46 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp11Q99K46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms