Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Higd1bQ99JY6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Higd1bQ99JY6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms