Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Def8Q99J78 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Def8Q99J78 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms