Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctu1Q99J10 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctu1Q99J10 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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