Protein–RNA interactions for Protein: Q923J1

Trpm7, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm7Q923J1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpm7Q923J1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm7Q923J1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm7Q923J1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms