Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf3Q922U1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf3Q922U1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms