Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb6Q922F4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms