Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp4Q921I6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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