Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca5Q91ZW3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms