Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rpe65Q91ZQ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rpe65Q91ZQ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rpe65Q91ZQ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpe65Q91ZQ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rpe65Q91ZQ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rpe65Q91ZQ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rpe65Q91ZQ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rpe65Q91ZQ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rpe65Q91ZQ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Rpe65Q91ZQ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpe65Q91ZQ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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