Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms