Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms