Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp3Q91W36 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms