Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itm2cQ91VK4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2cQ91VK4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms