Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhdc3Q8VEM9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhdc3Q8VEM9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms