Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc9Q8VC31 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms