Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms