Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c5Q8R2T8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms