Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r200Q8R281 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Vmn1r200Q8R281 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Vmn1r200Q8R281 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r200Q8R281 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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