Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
E2f4Q8R0K9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms