Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MyripQ8K3I4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms