Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stn1Q8K2X3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms