Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh3Q8K1E6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh3Q8K1E6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh3Q8K1E6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh3Q8K1E6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh3Q8K1E6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh3Q8K1E6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh3Q8K1E6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms