Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cc2d2aQ8CFW7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cc2d2aQ8CFW7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cc2d2aQ8CFW7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.9 ms