Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp11Q8CFF0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms