Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup88Q8CEC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nup88Q8CEC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms