Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc38Q8CDN8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc38Q8CDN8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc38Q8CDN8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc38Q8CDN8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc38Q8CDN8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms