Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms