Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm9958Q8C9U4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9958Q8C9U4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9958Q8C9U4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9958Q8C9U4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9958Q8C9U4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9958Q8C9U4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm9958Q8C9U4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9958Q8C9U4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9958Q8C9U4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm9958Q8C9U4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9958Q8C9U4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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