Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc186Q8C9S4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc186Q8C9S4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms