Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spef2Q8C9J3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spef2Q8C9J3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms