Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwc2Q8C8N3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vwc2Q8C8N3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms