Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf12Q8C8K3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms