Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms