Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc113Q8C5T8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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