Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Camsap2Q8C1B1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Camsap2Q8C1B1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Camsap2Q8C1B1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Camsap2Q8C1B1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Camsap2Q8C1B1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Camsap2Q8C1B1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms