Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp37Q8C0R0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp37Q8C0R0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms