Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpcpd1Q8C0L9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpcpd1Q8C0L9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpcpd1Q8C0L9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms