Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccser1Q8C0C4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccser1Q8C0C4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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