Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms