Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms