Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms