Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp38Q8BW70 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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