Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Triml1Q8BVP1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms