Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup54Q8BTS4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup54Q8BTS4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms