Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep55Q8BT07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms