Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me3Q8BMF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me3Q8BMF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me3Q8BMF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms