Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prpf18Q8BM39 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prpf18Q8BM39 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prpf18Q8BM39 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Prpf18Q8BM39 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf18Q8BM39 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Prpf18Q8BM39 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Prpf18Q8BM39 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Prpf18Q8BM39 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Prpf18Q8BM39 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf18Q8BM39 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms